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秦岭国家植物园是国际植物园保护联盟的成员单位,是国家在全国布局的16个国家植物园之一。近年来,该园在持续加强植物就地保护的同时,按照国家对I、II级植物保护和陕西省地方重点野生植物保护的要求,认真实施迁地保护,目前园区保育6512种野生植物,其中国家I级保护植物17种,国家II级保护植物104种,陕西省地方保护植物48种,建有30个专科专类园,是生物多样性保护、研究及园林园艺展示的重要基地。